TY  - THES
U1  - Bachelor Thesis
A1  - Zimmer, Tabea Cornelia
T1  - Integration von Daten und Methoden zum Zugriff und zur
Analyse vonGenotypisierungsdaten im Edge Computing Umfeld mittels Datencontainer
N2  - Aufgrund der bedeutenden Fortschritte im Bereich der Hochdurchsatzsequenzierungstechnologien und folglich dem exponentiellen Wachstum biologischer Daten entstehen in der Bioinformatik Herausforderungen bei der Speicherung und Analyse großer Datenmengen. Die umfangreichen
Genotypisierungsdaten der Gerste, welche als Referenzdatensatz vorlagen, wurden am Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK) durch Genotyping by Sequencing (GBS) erstellt. Zur effektiven Speicherung sowie Analyse dieser Daten wurden verschiedene Datenstrukturen erstellt und hinsichtlich Performance und Speicherbedarf evaluiert. Die Entwicklung verschiedener Java-Tools ermöglichte dabei das Einlesen, die Verarbeitung, sowie die Ausgabe dieser Daten zur effektiven Strukturierung und Analyse. Um die Anwendung dieser Java-Tools über Edge-Computing zu ermöglichen, wurde an der Erstellung von Datencontainern gearbeitet.
KW  - Edge computing
KW  - Bioinformatik
Y2  - 2020
ER  -