@phdthesis{Schwalbe, type = {Bachelor Thesis}, author = {Markus Schwalbe}, title = {Erstellung eines Tools zur Vorhersage von CRISPR/Cas Transformationseffizienzen und Off-Target Effekten}, abstract = {Die Arbeit befasst sich mit der Erstellung eines Tools zur Vorhersage von Transformationseffizienzen von CRISPR/Cas Systemen in Gerste (Hordeum vulgare L.). Es wurden 57 Zielsequenzen hinsichtlich ihrer Sequenzeigenschaften, wie GC Gehalt oder Entropie untersucht und Modelle f{\"u}r die Vorhersage von Effizienzen, f{\"u}r neue Sequenzen abgeleitet. Dabei konnten gute Vorhersagegenauigkeiten, erzielt werden. Au{\"s}erdem wurden mit Hilfe von k-mer Analysen Off-Target Effekte abgesch{\"a}tzt, wobei hier der Vorteil gegen{\"u}ber vergleichbaren Tools in der Verwendung von Sequenzrohdaten liegt. Somit kann das Tool auch f{\"u}r unassemblierte Genome genutzt werden.}, language = {de} }