@phdthesis{Garbe, type = {Bachelor Thesis}, author = {Martin Garbe}, title = {Erkennung von {\"A}hnlichkeitsbeziehungen wohldefinierter Muster mit Hilfe regul{\"a}rer Ausdr{\"u}cke}, url = {https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:bsz:mit1-opus-30238}, abstract = {In der Bachelorarbeit ,,Erkennung von {\"A}hnlichkeitsbeziehungen wohl definierter Muster in Membranproteinen mit Hilfe regul{\"a}rer Ausdr{\"u}cke\" wurde 32 Pfamfamilien, in Bezug auf Motive, untersucht.Als Grundlage dienten hierf{\"u}r 50 Sequenzmuster von Gerstein et al. [11]. Die Proteinsequenzen der verwendeten 32 Proteinfamilien, von deren Dom{\"a}nen keine Funktion bekannt ist, wurden auf Beinhalten dieser Muster hin untersucht. Im n{\"a}chsten Schritt wurde untersucht, welche dieser 50 Muster zusammen in einer Proteinsequenz auftreten, um so die Co - Co- Occurence festzustellen. Anhand der somit erhaltenen h{\"a}ufigsten Paarungen im transmembranen, nichttransmembranen und Transition - Bereich und mit Hilfe von bereits beschriebenen Mustern und Pattern von biologischen Datenbanken, wurde versucht, bestimmten Musterpaarungen aus der Arbeit von Gerstein et al. eine Funktion zuzuordnen bzw. eine Erkl{\"a}rung f{\"u}r ihr Auftreten in den Proteinen zu finden.}, language = {de} }