@phdthesis{Peter,
  type      = {Bachelor Thesis},
  author    = {Veronika Peter},
  title     = {Vorhersage der subzellul{\"a}ren Verteilung von Enzymaktivit{\"a}ten im Erbsensamen auf Basis von Expressionsdaten},
  url       = {https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:bsz:mit1-opus-23573},
  abstract  = {Die Erbse (Pisum sativum) wird aufgrund ihrer charakteristischen Biomasse-zusammensetzung als Modellorganismus f{\"u}r zahlreiche Stoffwechseluntersuchungen verwendet. Beispielsweise werden mithilfe von Enzymassays und den damit ermittelten kinetischen Parametern die Stoffwechselwege in mathematischen Modellen zusammengefasst. Speziell f{\"u}r die Erbse wurde in der vorliegenden Arbeit die maximale Reaktionsgeschwindigkeit diverser Enzyme zweier Pflanzen mit unterschiedlichem Genotyp, Wildtyp Eiffel und RNAi AGP3, analysiert. Auswirkungen der gentechnischen Ver{\"a}nderung fielen besonders bei dem direkt betroffenen Enzym auf. Die Modifikation des Genotyps erfolgte durch eine RNA-Interferenz, wodurch eine verminderte Genexpression mit einer reduzierten Enzymaktivit{\"a}t vorlag. Bei der Untersuchung des Saccharoseabbaus und der St{\"a}rkesynthese zeigten sich au{\"s}erdem ver{\"a}nderte Aktivit{\"a}ten der Phosphoglucose Isomerase, der Saccharose Synthase und anderen analysierten Enzymen. Mithilfe eines Microarrays, bei denen die Genexpression der eben genannten Erbsengenotypen analysiert wurde, und den darin enthaltenen Oligonukleotid -Sequenzen einzelner Isoformen wurde in verschiedenen Datenbanken nach homologen Sequenzen gesucht. Die neuen Sequenzen wurden dann in die Webapplikationen TargetP 1.1 und WoLF PSORT zur Vorhersage der subzellul{\"a}ren Lokalisierung eingesetzt. Allerdings erwiesen sich die Ergebnisse als unpr{\"a}zise, da die Sequenzen unvollst{\"a}ndig waren. Durch Expressionsdaten wurde die Signalst{\"a}rke der Isoenzyme prozentual ermittelt und anhand von maximaler Reaktionsgeschwindigkeit auf die Verteilung der einzelnen Aktivit{\"a}ten geschlossen. Diese Methode war jedoch sehr empfindlich gegen{\"u}ber {\"a}u{\"s}eren Einfl{\"u}ssen wie Temperatur oder Erntezeitpunkt. Daher ist es sinnvoll nach wesentlich genaueren Vorgehensweisen zur Vorhersage der subzellul{\"a}ren Verteilung von Enzymaktivit{\"a}ten zu suchen},
  language  = {de}
}