@phdthesis{Koch2014,
  type      = {Master Thesis},
  author    = {Stephan Koch},
  title     = {Analyse von Fischexpressionsdaten zur Klassifizierung von molekularen Che-mikalienwirkungen},
  url       = {https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:bsz:mit1-opus4-63035},
  year      = {2014},
  abstract  = {Durch Genexpressionsexperimente anModellorganismen versucht man das Genomund die Reaktion des Genoms auf {\"a}u{\"s}ere Einfl{\"u}sse zu erforschen. Chemikalien sind in der Lage die Expression des Genoms zu beeinflussen. Durch die Experimente ist es m{\"o}glich R{\"u}ckschl{\"u}sse auf die Wirkweisen der Chemikalien auf genomischer Ebene zu ziehen. Durch derartige Chemikalienexperimente wurden in der Vergangenheit bereits gro{\"s}e Mengen an Genexpressionsdaten erzeugt. Ein beliebter Modellorganismus f{\"u}r solche Versuche ist der Zebrab{\"a}rbling Danio rerio, der in seiner embryonalen Entwicklung optimale Vorrausetzungen mit sich bringt. Bei ihm kann man ph{\"a}notypische und genotypische Effekte der Chemikalien sehr gut beobachten, da er in diesem Zeitraum transparent ist und diese Phase nur f{\"u}nf Tage anh{\"a}lt. Anhand des Zebrab{\"a}rblings soll erforscht werden, ob gleichartige Chemikalien auf genomischer Ebene {\"a}hnliche Wirkweisen besitzen und sich in Gruppen zusammenfassen lassen. Desweiteren stellt sich die Frage, ob es eine allgemeine (Gegen)Reaktion auf den Einfluss der Chemikalien gibt, welche auf genomischer Ebene sichtbar wird. Dazu werden Genexpressionsdaten aus cDNA-Microarrayexperimenten verwendet, die in den Datenbanken des NCBI und EBI abgespeichert sind. Nachdem geeigenete Experimentaldaten ausgew{\"a}hlt wurden und auf ihre Qualit{\"a}t gepr{\"u}ft, wurden diese einer vereinheitlichten statistischen Analyse unterzogen. Die Ergebnisse dieser statistischen Analyse wurden untereinander auf identisch differentiell exprimierte Gene verglichen. Durch vereinheitlichte, allgemeine Analyse konnten Hinweise erbracht werden, dass es auf genomischer Ebene eine Antwort- und Gegenreaktion auf die Chemikalien gibt. Durch den Vergleich konnten 22 Gene ermittelt werden, die f{\"u}r das Binden und den Abbau der eingesetzten Chemikalie verantwortlich sind und experiement{\"u}bergreifend auftraten.},
  language  = {de}
}