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Entwicklung einer Webapplikation zur Visualisierung von Simulationstrajektorien

  • Biologische Prozesse können mithilfe von Modellen mathematisch analysiert werden und durch Visualisierungsapplikationen können die Ergebnisse der Modelle interpretierbar dargestellt werden. Das Modell befasst sich mit der Wasserrückführung in renalen Hauptzellen. Dabei wurden die primäre Hormonantwort, die Bewegung von Vesikeln sowie die Exozytose als auch die Endozytose modelliert und simuliert. Diese Arbeit beschreibt die Entwicklung einer Webapplikation um Simulationstrajektorien zu visualisieren. Es wurde eine räumliche Darstellung des Modells entwickelt, welche Kompartimente anordnet und Konzentrationen einzelner Moleküle farblich darstellt. Durch die Positionierung von Kompartimenten erhält man eine Vorstellung der Topologie des Systems. Durch die Darstellung der Konzentrationen kann das Verhalten einzelner Moleküle im Modell untersuchen werden. Auch die Bewegungen von Vesikeln können abgebildet werden. Liniendiagramme einzelner Moleküle zeigen Konzentrationen über den gesamten Zeitraum. Das Tool bietet die Möglichkeiten, die Trajektorien zu reduzieren durch eine Filterfunktion, welche die gefilterten Daten summiert zurückgibt. Durch interaktive Elemente, einfache Bedienung und die Verfügbarkeit im Internet entspricht das Tool heutigen Standards für Visualsierungstools. Zukünftig sollte an der Darstellung von Zahlen und Einheiten gearbeitet und Moleküle mit Datenbanken crossverlinkt werden.

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Metadaten
Author:Felix Erichson
Advisor:Dirk Labudde, Christoph Leberecht
Document Type:Bachelor Thesis
Language:German
Year of Completion:2019
Granting Institution:Hochschule Mittweida
Release Date:2020/07/22
GND Keyword:Web-Applikation; Visualisierung
Institutes:Angewandte Computer‐ und Bio­wissen­schaften
Dewey Decimal Classification:006.76 Web-Applikation
Open Access:Frei zugänglich
Licence (German):License LogoEs gilt das UrhG