Validierung und Optimierung einer Methode zur Untersuchung von exonüberspannenden Kopienzahlaberrationen mittels Long-Range-PCR und nachfolgender Schmelzkurvenanalyse
Validation and optimization of a longrange-PCR method followed by high resolution melting curve analysis for screening copy number variations of whole exons
- Amplifikation von bekannten Kopienzahlvariationen mit ihren umgebenden Sequenzbereichen in einer Long-Range-Polymerase-Kettenreaktion und Auswertung der Produkte mittels Hochauflösender Schmelzkurvenanalyse auf einem LightCycler 480. Unterscheidung mehrerer CNVs von mitgeführten Referenzen durch die zwei Methoden der Hochauflösenden Schmelzkurvenanalyse Meltcurve-Genotyping und Gene Scanning. Grenzen, wie zum Beispiel Pseudogene, welche beachtet werden müssen oder eine eingeschränkte Eignung des Verfahrens für den Nachweis von Duplikationen wurden deutlich. Es zeigte sich zudem, dass eine große Menge an Referenzen empfehlenswert ist, die Amplifikationsparameter in der LR-PCR optimiert sein sollten und interkalierende Farbstoffe der zweiten Generation für die Verwendung in der HRM verwendet werden sollten. Bevor das Verfahren für den Nachweis von CNVs in Proben eingesetzt werden kann, sind weitere Untersuchungen und Optimierungen vorzunehmen.
Download full text files
- Bachelorarbeit_dunrath_M37644.pdf
Additional Services
Statistics
| Author: | Daniel Unrath |
|---|---|
| Document Type: | Bachelor Thesis |
| Language: | German |
| Year of Completion: | 2017 |
| Granting Institution: | Hochschule Mittweida |
| Release Date: | 2018/08/16 |
| GND Keyword: | Kopienzahlvariation , Genamplifikation , Polymerase-Kettenreaktion |
| Institutes: | Angewandte Computer‐ und Biowissenschaften |
| Open Access: | Innerhalb der Hochschule |
| Licence (German): |  Urheberrechtlich geschützt |
