Nanopore sequencing of cryptorchidism associated genes for identification of genetic variants in German Sheep Poodle
Nanoporensequenzierung von Kryptorchismus-assoziierten Genen zur Identifizierung von genetischen Variationen in Schafpudeln
- Cryptorchidism describes a disease, in which one or both testes do not descend into the scrotum properly. With a prevalence of up to 10%, cryptorchidism is one of the most common birth defects of the male genital tract. Despite its associated health risks and accompanying economic damage, resulting from surgery and losses in breeding, studies on canine cryptorchidism and its causes are relatively rare. In this study a relational database for genetic causes of cryptorchidism was established and used as a basis for the identification of candidate genes. Associated regions were analysed by nanopore sequencing with the goal to identify genetic variants correlated with cryptorchidism in German Sheep Poodle.
- Kryptorchismus beschreibt eine Krankheit, bei der einer oder beide Hoden nicht ordnungsgemäß in den Hodensack absteigen. Mit einer Prävalenz von bis zu 10% ist Kryptorchismus einer der häufigsten Geburtsfehler des männlichen Genitaltrakts. Trotz der damit verbundenen Gesundheitsrisiken und der einhergehenden wirtschaftlichen Schäden, die durch Operationen und Zuchtverluste verursacht werden, sind Studien zu Kryptorchidism bei Hunden und dessen Ursachen selten. In dieser Studie wurde eine relationale Datenbank für genetische Ursachen von Kryptorchismus erstellt und als Grundlage für die Identifizierung von Kandidatengenen verwendet. Assoziierte Regionen wurden durch Nanoporensequenzierung analysiert, um genetische Varianten zu identifizieren, die mit Kryptorchismus bei Schafspudeln korrelieren.
Author: | Rebecca Prause |
---|---|
Advisor: | Röbbe Wünschiers, Robert Leidenfrost |
Document Type: | Master's Thesis |
Language: | English |
Year of Completion: | 2019 |
Granting Institution: | Hochschule Mittweida |
Release Date: | 2021/03/04 |
GND Keyword: | Kryptorchismus |
Institutes: | Angewandte Computer‐ und Biowissenschaften |
DDC classes: | 616.68 Kryptorchismus |
Open Access: | Innerhalb der Hochschule |
Licence (German): | Urheberrechtlich geschützt |