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Die Biometrie bildet in heutigen Zeiten in den Bereichen der forensischen Arbeit und der Sicherheit ein besonderen Teil. Dabei werden in heutigen Verfahren biometrische Merkmale wie Gesichtsmaße, Fingerabdrücke oder auch Irismuster verwendet. Jedoch stößt die Verwendung dieser Merkmale oft an ihrer Grenzen, wenn es darum geht, vermummte Täter auf Überwachungsaufnahmen zu identifizieren. An dieser Stelle soll der Täter mittels eines Rigs auf der Aufnahme vermessen werden. Die erhaltenen Maße sollen anschließend mit den Maßen von Personen im Reale verglichen werden, um dadurch den Täter von der Aufnahme zu identifizieren. In dieser Arbeit wird ein gegebener Datensatz näher untersucht. Der Datensatz enthält anthropometrische Maße, Front-Rigs (2D-Rigs) sowie 3D-Rigs von 170 Frauen und 170 Männern. Ziel soll es sein, die im Datensatz gegebene Separierbarkeit mittels eines optimalen Trenn- beziehungsweise Klassifikationsverfahrens nachzuweisen. Zum Einen wird die Vergleichbarkeit der Front- und 3D-Rigs überprüft. Dafür wird eine Möglichkeit gesucht, eine mögliche Abweichung zwischen den Dimensionen der Rigs mittels eines allgemeinen Fehlers beziehungsweise Verhältnisses auszudrücken. Zum Anderen werden verschiedene Klassifikationsverfahren durchgeführt, die zwischen zwei Körperhöhengruppen gegebene Separierbarkeit optimal nachzuweisen. Abschließend wird ein weiteres Merkmal neben der Körperhöhe gesucht, um Personen in Gruppen einzuteilen. Im Verlauf der Arbeit wird ersichtlich, dass zwischen den Front-Rigs und 3DRigs ein Unterschied besteht, der sich jedoch schwer in ein allgemeinen Fehler beziehungsweise ein allgemeines Verhältnis fassen lässt. Mittels der Manhattan-Distanz kann die Separierbarkeit nur schwer nachgestellt werden. Durch die Verwendung von k-NNs und logistischen Regressionen ist die Separierbarkeit trotz auftretender Falschklassifikationen nachzuweisen. Als weiteres Merkmal zur Körperhöhe wird das Verhältnis von Oberkörper zu Unterkörper betrachtet. Die mittels dieses Verhältnisses bestimmten Gruppen sind ebenfalls nachweisbar. In Zukunft sollte der Unterschied zwischen Front- und 3D-Rigs verkleinert beziehungsweise verallgemeinert werden, um die Vergleichbarkeit zu steigern. Des Weiteren sollte die Separierbarkeit mittels weiterer Klassifikationverfahren nachgewiesen werden. Außerdem sollte über eine Erweiterung des Datensatzes um weitere Individuen oder auch andere Körperhöhen nachgedacht werden. Zudem sollten auch andere Merkmale zur Gruppierung der Personen weiter untersucht werden.
Die Bakterien Francisella tularensis sind die Erreger der Zoonose Tularämie. Eine bekannte und wichtige Unterart dieser ist die Bakterienspezies Francisella tularensis subsp. holarctica, welche auch als Typ B bezeichnet werden. Diese treten auf der ganzen nördlichen Hemisphäre und eben auch innerhalb Deutschlands auf. Es sind 3 bekannte Untergruppen des Typ B zurzeit bekannt, welche sich in genetischer Hinsicht zu einem geringen Teil unterscheiden. Um die Ausbreitung der Tularämie besser verstehen und Ausbrüche verhindern zu können, ist die Bestimmung des genauen Genotyps unabdinglich. 36 Isolate von Tieren aus Deutschland aus dem Jahr 2015 wurden mittels Real-time PCR genotypisiert, um anschließend die Verteilung der unterschiedlichen Genotypen in Deutschland mit Proben aus den vergangenen Jahren 2006 bis 2014 vergleichen zu können.
Cryptorchidism is the most common disorder of sex development in dogs. It describes a failure of one or both testes to descend into the scrotum in due time. It is a heritable multifactorial disease. In this work, selected dogs of a german sheep poodle breed were sequenced with nanopore sequencing and subsequently examined for genetic variations correlating with cryptorchidism. The relationships of the studied dogs were also analyzed and visually processed.
Genetic sex determination of ancient DNA samples based on one simple mathematical algorithm, which considers the number of mapped reads on autosomal, X, and Y chromosomes. The algorithm is implemented in one command line tool - SiD. SiD is used to deter-mine the sex of 16 samples, which have been shotgun sequenced and captured with a 1240k panel.
Pollinating insects are of vital importance for the ecosystem and their drastic decline imposes severe consequences for the environment and humankind. The comprehension of their interaction networks is the first step in order to preserve these highly complex systems. For that purpose, the following study describes a protocol for the investigation of honey bee pollen samples from different agro-environmental areas by DNA extraction, PCR amplification and nanopore sequencing of the barcode regions rbcL and ITS. It was shown, that the most abundant species were classified consistently by both DNA barcodes, while species richness was enhanced by single-barcode detection of less abundant species. The analysis of the the different landscape variables exhibited a decline of species richness, Shannon diversity index, and species evenness with increasing organic crop area. However, sampling was only carried out in August and further investigations are suggested to display a more complete picture of honey bee foraging throughout the seasons.
Generierung von in silico Modellen zur Vorhersage der Bioverfügbarkeit potentieller Arzneistoffe
(2017)
Ziel dieser Arbeit ist es, eine essentielle Eigenschaft (die Bioverfügbarkeit) von Verbindungen zur Auswahl von neu synthetisierten Verbindungen, vorherzusagen. Dafür wird ein QSPR Modell erarbeitet, das die orale Bioverfügbarkeit vorhersagt. Es werden verschiedene Modelle erstellt, die auf unterschiedlichen Trainingsmethoden beruhen. Die Performance der Modelle wird durch den Korrelationskoeffizienten (R2) bewertet.
In this work, a transgenic zebrafish line that expresses the fluorophore dsRed under the endogenous zebrafish cochlin promotor is supposed to be established, using the CRISPR/Cas9 system. dsRed was cloned into a pBluescript vector, followed by the cloning of the cochlin locus into this vector. This bait construct was then supposed to be micro injected into wild type AB zebrafish embryos. The micro injection of Cas9 mRNA, single guide RNA and a bait construct was practiced with the tyrosinase gene, which was disrupted using CRISPR/Cas9.
In the following study we evaluated capabilities of how a simple autoencoder can be used to trainGeneralized Learning Vector Quantization classifier. Specifically, we proved that the bottlenecks of an autoencoder serve as an "information filter" which tries to best represent the desired output in that particular layer in the statistical sense of mutual information.
Autoencoder model was trained for purely unsupervised task and leveraged the advantages by learning feature representations. As a result, the model got the significant value of the accuracy. Implementation and tuning of the model was carried out using Tensor Flow [1].
An extra study has been dedicated to improve traditional GLVQ algorithm taken from sklearn-lvg [2] using the bottleneck from an autoencoder.
The study has revealed potential of bottlenecks of an autoencoder as pre-processing tool in improving the accuracy of GLVQ. Specifically, the model was capable to identify 75% improvements of accuracy in GLVQ comparing to original one, which has about 62%. Consequently, the research exposed the need for further improvement of the model in the present problem case.
Die JavaScript-Bibliothek React ist inzwischen seit mehreren Jahren eine beliebte und weit verbreitete Technologie im Bereich der Frontend-Webentwicklung. In Kombination mit Redux ermöglicht React die Erstellung funktionaler Benutzeroberflächen selbst für komplexe Anwendungen. Es stellt sich die Frage, wie solche React-Anwendungen am besten zu testen sind. Zwei häufig genutzte Test-Frameworks für diesen Zweck sind Mocha und Jest. Diese werden in dieser Bachelorarbeit an Hand zuvor definierter Qualitätskriterien in mehreren Kategorien miteinander verglichen und so auf ihre Tauglichkeit für das Testen von React-Applikationen untersucht. Als Schwerpunkt der Gegenüberstellung wird eine Reihe von Tests mit beiden Frameworks für eine bereits bestehende App auf Basis von React und Redux implementiert. Am Ende steht die Beantwortung der Frage, welches der beiden Frameworks auf Grundlage der Untersuchungsergebnisse für das Testen von React-Anwendungen vorzuziehen ist.
Bereits 1886 entdeckte der Kinderarzt Theodor Escherich ein neuartiges Bakterium, welches später den Namen Escherichia (E.) coli bekommt, im Darm von Kleinkindern. Im Laufe der Jahre fand man heraus, dass E. coli sowohl probiotische, als auch pathogene Eigenschaften haben kann. Pathogene E. coli können eine ganze Reihe gefährlicher Durchfallerkrankungen auslösen, was eine sichere Diagnose der Erreger notwendig macht. Die zuverlässigste Analysemethode ist die Polymerase-Ketten-Reaktion (PCR). Dabei können kleinste Mengen DNA vervielfältigt und anschließend analysiert werden. Ziel dieser Arbeit ist die Entwicklung und Validation einer Multiplex-PCR, um insgesamt sieben verschiedene pathogenen E. coli nachweisen und unterscheiden zu können