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Für die genetische Untersuchung eines Organismus ist es heutzutage unerlässlich dessen Genom vorliegen zu haben. Diese Arbeit schafft diese essentielle Grundlage für die weiteren Untersuchungen des altdeutschen Schafpudels. Die Assemblierung des Genoms wird dabei mit Illumina-Short-Reads und Nanopore-Long-Reads durchgeführt. Es werden drei verschiedene Ansätze getestet: das Short-Read-Assembly, das Long-Read-Assembly und das Hybrid-Assembly. Die Assemblies aller drei Ansätze werden im Folgenden auf ihre Qualität überprüft und miteinander verglichen, um das Assembly schrittweise zu verbessern. Das Ziel ist, dass das Assembly ähnliche Qualitäts-Metriken wie die Chromosomen-Level-Assemblies der bisher schon assemblierten Genome anderer Hundearten aufweist.
Vergleichende Genanalyse zur Identifizierung human-pathogener, allergener und toxinogener Pilze
(2011)
In dieser Arbeit wird die Erstellung eines Datenpools beschrieben. Dieser beinhaltet Sequenzdaten eines zuvor ausgewählten Zielgens (rRNA-Operon). Es wird die Generierung der Datenbank und die Qualitätssicherung der Sequenzen erläutert. Ebenso sind erste Anwendungen des Datenpools, als Grundlage für die artspezifische Identifizierung von medizinisch relevanten Pilzen aufgezeigt.