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Document Type
- Bachelor Thesis (1)
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Language
- German (1)
Keywords
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Die Arbeit befasst sich mit der Erstellung eines Tools zur Vorhersage von Transformationseffizienzen von CRISPR/Cas Systemen in Gerste (Hordeum vulgare L.). Es wurden 57 Zielsequenzen hinsichtlich ihrer Sequenzeigenschaften, wie GC Gehalt oder Entropie untersucht und Modelle für die Vorhersage von Effizienzen, für neue Sequenzen abgeleitet. Dabei konnten gute Vorhersagegenauigkeiten, erzielt werden. Außerdem wurden
mit Hilfe von k-mer Analysen Off-Target Effekte abgeschätzt, wobei hier der Vorteil gegenüber vergleichbaren Tools in der Verwendung von Sequenzrohdaten liegt. Somit kann das Tool auch für unassemblierte Genome genutzt werden.