500 Naturwissenschaften
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Mit dieser Arbeit wird eine Methodik vorgestellt, strukturbiologische Netzwerke auf der Basis von Experimenten zur Affinitätsaufreinigung mit gekoppelter Massenspektrometrie zu generieren. Zur Anwendung kommen dafür verschiedene spezialisierte Tools in einem strukturierten Workflow. Es wird damit eine Möglichkeit geboten, anhand der Sequenz- und Interaktions-Informationen der analysierten Experimente ein strukturelles Protein-Protein-Interaktions-Netzwerk zu generieren.
Die vorliegende Arbeit beschäftigt sich mit der Charakterisierung des shh-Inhibitors GANT-61, in den Embryonen des Zebrabärblings. Es wurde eine Methode für die Untersuchung der internen Konzentrationen von GANT-61 in den Embryonen des Zebrabärblings in Abhängigkeit unterschiedlicher Expositionen mit Hilfe der HPLC entwickelt und modifiziert. Für die Wahl der Konzentrationen des Expositionsmediums wurde eine 24 h Exposition durchgeführt und der LC50-Wert bestimmt. In den Studien von Büttner et al. (2012) wurde GANT 61 als shh-Inhibitor in Zellkulturen identifiziert. Diese Ergebnisse konnten bei Fischembryonen des Zebrabärblings nicht bestätigt werden. Doch wurde eine Induktion verschiedener Gene, wie sycp3l und lim2.2 beobachtet. Zur Charakterisierung der lokalen Wirkung von GANT-61 in den Fischembryonen sollte eine In situ-Hybridisierung mit den Proteinen SYCP3L und LIM2.2 durchgeführt werden. Zur Vorbereitung des Verfahrens wurde eine quantitative real-time PCR der Gene sycp3l und lim2.2 durchgeführt.
Cyanobakterien gehören zu den evolutionär ältesten Bewohnern unserer Erde und haben sich während Jahrmilliarden an stark differierende Umweltbedingungen adaptiert. Sie besiedeln teils Habitate mit widrigsten Konditionen, seien es bspw. im höchsten Maß nährstoffarme Gebiete oder jene mit extremer Hitze [Fuchs & Schlegel, 2007]. Durch die genomischen Beschaffenheiten sind Cyanobakterien in der Lage, Wasserstoff zu produzieren. Durch bioverfahrenstechnische Fortschritte sowie den biologisch-fachlichen Fortschritt der Kenntnisse der Stoffwechselvorgänge kann es in einigen Jahren vermutlich möglich werden, dass auf effektive Weise dieser Biowasserstoff gewonnen und als regenerativer Kraftstoff eingesetzt werden kann [URL-4; URL-5; URL-6; Bandyopadhyay et al., 2010]. Dadurch könnte in einem hohen Maß der Einsatz an fossilen Energieträgern reduziert werden. Im Umfang der vorliegenden Masterarbeit werden theoretische sowie experimentelle metabolische Daten des aktuellen wissenschaftlichen Standes der Cyanobakterien Synechocystis sp. PCC 6803 und Nostoc sp. PCC 7120 mittels einer umfangreichen Literaturrecherche aufgearbeitet, eine Analyse von Visualisierungssoftware durchgeführt und metabolische Modelle des Wasserstoffmetabolismus erstellt. Weiterhin wird die Thematik der Etablierung einer Knowledgebase für Cyanobakterien diskutiert [Karr et al., 2012]. Diese Arbeit ist Teil des EU-Forschungsprojekts CyanoFactory (FP 7, Fördernummer 308518).
Die Bachelorarbeit befasst sich mit dem Zuordnen von Reads eines Datensatzes, der aus ausdem sequenzierten Metatranskriptom von 6 verschiedenen Organismen besteht, zu Genomen ausgewählter Organismen und die Darstellung dieser auf einer Stoffwechselkarte. Dafür wurde ein Programm in Python geschrieben, dass die Gensequenzen der einzelnen Genome mit den Reads des Datensatzes, mit der Hilfe von BLAST, vergleicht. Die Anzahl der Übereinstimmungen spielt die Stärke der Expression der einzelnen Enzyme wieder und wurde auf der Stoffwechselkarte „Biochemical Pathways“ graphisch dargestellt. Je nach Trefferanzahl wird das Enzym mit einer bestimmten Farbe hervorgehoben, so dass mit einem flüchtigen Blick Expressionsbereiche und die Stärke dieser leicht zu erkennen sind. Des Weiteren wird die genaue Anzahl der Treffer und die EC-Nummer angezeigt. Neben des Bildes speichert das Programm die Ergebnisse in Textdateien, die tabellarisch aufgebaut sind und deshalb mit einem Tabellenkalkulationsprogramm importiert werden können. Damit nicht jeder Organismus einzeln analysiert werden muss, ist eine Methode geschrieben worden, die mehrere Organismen nacheinander mit dem Datensatz vergleicht, und danach die Ergebnisse miteinander vergleicht. Außerdem wurde eine PROSITE Pattern Suche eingebaut, um EC-Nummern, die in keinem Genom vermerkt sind, in dem Datensatz dennoch zu finden.
Aufbauend auf vorangegangenen Untersuchungen zur differentiellen Expression von Transkripten in Zellen des Hodgkin-Lymphoms wird in dieser Arbeit die Expression von Gen-assoziierten HERV-Transkripten untersucht. Weiterhin soll der Einfluss von Östrogen auf die Expression überprüft werden. Dabei sollen Hodgkin-Lymphom-Zelllinien sowie lymphoblastoide Zellen als Untersuchungsmaterial dienen. Als Vergleichsbasis werden Zellen des peripheren Blutes eingesetzt. Außerdem soll speziell die Funktion des Gens CYP4Z1 in Hodgkin-Lymphom-Zellen als Grundlage für weiterführende Untersuchungen dienen.
In der vorliegenden Arbeit werden strukturelle und funktionelle Proteinmotive hinsichtlich ihrer energetischen Charakteristika untersucht und nach energetischen Abständen über hierarchische Clusterverfahren geclustert. Dabei sollen Gesetzmäßigkeiten offen gelegt werden, die sich über die Abstraktionsebenen der Sequenz, Struktur, Funktion und der Energie erstrecken.
3-D Deformationsmessung
(2009)
Ziel der Diplomarbeit ist es, zu den herkömmlichen geodätischen Messmethoden eine alternative Methode für die Messung von dreidimensionalen Deformierungen zu entwickeln. Die Basiskomponente für die Messung bildet der 3 – Achsen Beschleunigungssensor ADXL 330 von Analog Devices. Nach Erarbeitung mathematischer Grundlagen wird eine Prototyp – Hardware mit verschiedenen Schnittstellen entwickelt und angefertigt. Durch die Weiterverarbeitung der Messwerte durch ein Mikrocontroller – System mit Peripherie und Auslese – Software werden einerseits die Tauglichkeit der Messung selbst überprüft und weiters die Genauigkeit der Prototyp – Hardware getestet. Eine Zusammenfassung der Ergebnisse sowie ein Ausblick auf mögliche Optimierungen schließen diese Arbeit ab.
In meiner Bachelorarbeit beschäftige ich mich mit der allgemeinen Entwicklung von Mobile- TV und den daraus entstandenen Komplikationen der Vermarktung. Neben einer allgemeinen Beschreibung von Mobile- TV und der Vorstellung derzeitiger Technik erfolgt die Analyse einer Umfrage, die ich an Hamburger Schulen durchgeführt habe, um festzustellen, inwiefern die Popularisation bei Jugendlichen voran geschritten ist, welches die Zielgruppe ist und wie das Interesse sowie die Nutzungsszenarien aussehen. Schließlich erfolgt ein Fazit, ob und mit welcher Technik eine Markteinführung von Mobile- TV zu realisieren ist
Ziel der Diplomarbeit ist es zum einen die Schallausbreitung im akustischen Wellenleiter (Kundtsches Rohr) unterhalb der ersten Quermode mit der Software MATLAB zu modellieren. Zum anderen werden Algorithmen zur Umsetzung eines einkanaligen, feedforward Antischallsystems vorgestellt und bewertet. Weiterhin ist die messtechnische Ermittlung der Schalldruckpegelminderung im Kundtschen Rohr, in Abhängigkeit vom Phasen- und Amplitudenfehler, Gegenstand dieser Arbeit. Abschließend wird auf die Verwendbarkeit des AD/DA-Wandlers Fireface 800 in einem Antischallsystem eingegangen.