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Für die genetische Untersuchung eines Organismus ist es heutzutage unerlässlich dessen Genom vorliegen zu haben. Diese Arbeit schafft diese essentielle Grundlage für die weiteren Untersuchungen des altdeutschen Schafpudels. Die Assemblierung des Genoms wird dabei mit Illumina-Short-Reads und Nanopore-Long-Reads durchgeführt. Es werden drei verschiedene Ansätze getestet: das Short-Read-Assembly, das Long-Read-Assembly und das Hybrid-Assembly. Die Assemblies aller drei Ansätze werden im Folgenden auf ihre Qualität überprüft und miteinander verglichen, um das Assembly schrittweise zu verbessern. Das Ziel ist, dass das Assembly ähnliche Qualitäts-Metriken wie die Chromosomen-Level-Assemblies der bisher schon assemblierten Genome anderer Hundearten aufweist.
Bei Hodenhochstand, auch Kryptorchismus genannt, handelt es sich um eine der am häufigs- ten auftretenden Störungen der Geschlechtsentwicklung bei Hunden. Die Ursachen für diese Krankheit sind bisher unklar. Es wird davon ausgegangen, dass es multifaktorielle Auslöser gibt. Um den genetischen Hintergrund dieser Krankheit bei der Rasse Altdeutscher Schafpudel zu betrachten, wurden in dieser Studie ausgewählte Hunde einer Zucht untersucht. In diesem Zusammenhang wurde eine Visualisierung der Verwandtschaftsverhältnisse einer vorangegangenen Studie um die untersuchten Individuen ergänzt. Die Nanoporensequenzierungen wurde für die Analyse von sechs Genloci genutzt. Diese Sequenzdaten wurden anschließend auf Sequenz- und Strukturvarianten untersucht. Diese Arbeit vergleicht die Resultate mit vorausgegangenen Untersuchungen, um einen Zusammenhang zwischen Kryptorchismus und einer detektierbaren genetischen Veränderung zu ermitteln.