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Nutzung der Nanoporensequenzierung zur Untersuchung genetischer Varianten in Zusammenhang mit Kryptorchismus beim Altdeutschen Schafpudel

Application of nanopore sequencing for the analysis of genetic variants related to cryptorchidism in Old German Sheep Poodle

  • Bei Hodenhochstand, auch Kryptorchismus genannt, handelt es sich um eine der am häufigs- ten auftretenden Störungen der Geschlechtsentwicklung bei Hunden. Die Ursachen für diese Krankheit sind bisher unklar. Es wird davon ausgegangen, dass es multifaktorielle Auslöser gibt. Um den genetischen Hintergrund dieser Krankheit bei der Rasse Altdeutscher Schafpudel zu betrachten, wurden in dieser Studie ausgewählte Hunde einer Zucht untersucht. In diesem Zusammenhang wurde eine Visualisierung der Verwandtschaftsverhältnisse einer vorangegangenen Studie um die untersuchten Individuen ergänzt. Die Nanoporensequenzierungen wurde für die Analyse von sechs Genloci genutzt. Diese Sequenzdaten wurden anschließend auf Sequenz- und Strukturvarianten untersucht. Diese Arbeit vergleicht die Resultate mit vorausgegangenen Untersuchungen, um einen Zusammenhang zwischen Kryptorchismus und einer detektierbaren genetischen Veränderung zu ermitteln.
  • Undescended testicles, also called cryptorchidism, is one of the most common disorder of sexual development in dogs. The causes of this disease are still unclear. It is assumed that there are multifactorial triggers. In order to look at the genetic background of this disease in the breed Old German sheep poodle, selected dogs of a breeding were examined in this study. In this context, a visualisation of the relationships of a previous study was supplemented by the examined individuals. Nanopore sequencing was used to analyse six gene loci. This sequence data was then analysed for sequence and structural variants. This work compares the results with previous studies to determine a relationship between cryptorchidism and a detectable genetic change.

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Metadaten
Author:Lisa Lorenz-Grolle
Advisor:Röbbe Wünschiers, Nils Schön
Document Type:Master's Thesis
Language:German
Year of Completion:2023
Granting Institution:Hochschule Mittweida
Release Date:2023/09/12
GND Keyword:Kryptorchismus; Pudel
Page Number:91
Institutes:Angewandte Computer‐ und Bio­wissen­schaften
DDC classes:616.68 Kryptorchismus
Open Access:Frei zugänglich
Licence (German):License LogoUrheberrechtlich geschützt